Musca domestica L. (Diptera: Muscidae)’de Katyon ATPaz Gen Ailesinin Genom Çapında Analizi
Musca domestica L., patojenleri bulaştırarak ve önemli
ekonomik kayıplara neden olarak insan ve hayvan sağlığını
tehdit eden önemli bir zararlıdır. Geleneksel insektisitlere karşı
yaygın direnç, vektör kontrolü için yeni moleküler hedeflerin
keşfedilmesini zorunlu kılmaktadır. Hücresel homeostaz, sinir
impulsu iletimi ve osmoregülasyon için temel olan Katyon ATPaz
gen ailesi, umut verici bir hedefi temsil etmektedir. Bu çalışma,
M. domestica, Aedes albopictus ve Drosophila melanogaster
genomlarında 36 Katyon ATPaz genini tanımlayan genom
çapında bir analiz sunmaktadır. Gen yapıları, korunmuş motifler
ve fizikokimyasal özellikler kapsamlı bir şekilde karakterize
edilmiştir. 13 M. domestica Katyon ATPaz proteini, 927 ile 1602
kalıntı arasında değişen amino asit uzunlukları ve 102.4 ile 179.8
kDa arasında değişen moleküler ağırlıklar sergilemiştir. Teorik
izoelektrik noktaları 5.30 ile 6.11 arasında değişirken, alifatik
indeks değerleri (84.72–101.78) yüksek alifatik içeriği ortaya
koymuştur.
Karşılaştırmalı filogenetik analizler, evrimsel geçmişlerini ve
yapısal farklılıklarını aydınlatmıştır. Dahası, 3B modelleme,
etkileşim ağları ve Gen Ontolojisi (GO) analizleri ile işlevsel
özellikleri değerlendirilmiştir. In silico anotasyonlar, inorganik
katyonların transmembran taşınmasının yanı sıra kalsiyum ve
metal iyonu homeostazındaki kritik rollere işaret etmektedir.
Domain analizleri, sitozolik kalsiyum regülasyonuna aktif katılımı
gösteren P-tipi ATPaz domainlerinin varlığını doğrulamıştır. M.
domestica’daki Katyon ATPaz ailesinin ilk kapsamlı analizini
sunan bu araştırma, yenilikçi vektör kontrol stratejilerinin
geliştirilmesi için temel bir çerçeve oluşturmaktadır.
